Sur les six citadelles corses, la citadelle de Corti est la seule à l'intérieur des terres. Le piton était déjà fortifié au  IXè siècle, mais c'est en 1419 que Vicentello d'Istria, vice-roi de Corse pour le roi d'Aragon, s'en rendit maître et fit construire le nid d'aigle. Cette place-forte sera ensuite occupée par les seigneurs féodaux corses, les Génois puis les Français. L'enceinte de la citadelle renfermait des maisons, ainsi qu'une chapelle. L'ensemble fut remanié sous Louis XVI, puis sous Louis Philippe qui lui donna son profil actuel. Voulant en préciser les limites, il fit démolir la chapelle et les maisons comprises dans l'enceinte. Les habitants expropriés occupèrent dans les 'Lubiacce' l'immeuble dit des '300 propriétaires' contruit à cette occasion.

Les bâtiments militaires furent alors occupés par une partie des garnisons de la ville, puis convertis en prison centrale pour les détendus politiques. Pendant la guerre 1939-1945, sous l'occupation italienne, les patriotes corses y furent incarcérés.

La citadelle fut occupée de 1962 à 1984 par la Légion étrangère repliée d'Algerie. Ce site à été classé Monument Historique en 1977.La visite de la citadelle (jusqu'au Nid d'Aigle) est aujourd'hui accessible depuis le Musée de la Corse. Cependant, on peut acceder librement au belvédère (en contrebas de la citadelle) d'où la vue panoramique sur la ville est intéressante.Tout près,  vous serez accueilli dans les bureaux de l'Office de Tourisme Centru di Corsica.