L'université fut créée en 1755 par l'illustre général Pasquale Paoli, au coeur de la ville de Corti, alors capitale de la Corse indépendante (1755-1769), afin de dispenser une formation de qualité aux cadres de la toute jeune nation corse, et d'y propager la phisolophie des Lumières. Son siège, situé au Palazzu Naziunale, est en 2004 réinvesti par la présidence de l'université de Corse qui décide d'y installer les instances décisionnelles de ces principaux services, dans un geste hautement symbolique, inscrivant ainsi ce lieu dans une continuité historique momentanement interrompue. Les portes du savoir se fermèrent à la suite de la conquête militaire francaise de 1769, et ne purent se rouvrir qu'en 1981, grâce à une forte mobilisation de la communauté corse. Aujourd'hui, elle compte environ 4000 étudiants au sein d'une ville qui avoisine les 6800 âmes.